El almirante Kirk al mando de la nave Enterprise regresa a casa tras sufrir graves daños en una batalla con Khan y la pérdida irreparable del capitán Spock.
La tripulación del Enterprise recibe el aviso que se ha detectado algún tipo de vida orgánica en el nuevo planeta Genesis y hacia allí se dirigen con la esperanza de encontrar a Spock. Mientras tanto los militares Klingon están estudiando las posibilidades que ofrece Genesis para establecer en ese territorio alguna de sus bases.